Ameliyatlarda kullanılan aletlerin mikroplardan arındırılması işlemine sterilizasyon denir. Ayrıca sterilizasyon deyimi kadın veya erkeklerde yapılan kısırlaştırma ameliyatı için de kullanılmaktadır. Sterilizasyon için en çok kuru sıcaklık veya sıcak basınçlı buhar kullanılır. Genel olarak sterilizasyon, alet ve çamaşırların konduğu tromel denen kutuların otoklav denen aletlerde 1 atmosfer basınç altında 120°C sıcaklıkta 20 dakika bırakılmasıyla elde edilir. Isıya karşı hassas olan ve bozulan bazı maddeler ise etilen oksit veya propilen oksit gazı ile sterilize edilebilir. Bazı ilaçlar da ışığın mikropları öldürücü etkisinden yararlanılarak sterilize edilmektedir. Bu amaçla dalga boyu 2540-2800 A° olan ultraviyole ışınları, gamma veya katot ışınları da kullanılmaktadır. Ameliyat, mikroplardan arınmış bir ortamda, ger çekten temiz yani steril kılınmış aletlerle yapılır.