Kortizon türevi ilaçlar alerji tedavisinde temel bir önem taşır. Öbür tedavi yöntemlerine dirençli birçok ağır olguda kortizon kısa zamanda düzelme sağlar. Bununla birlikte kortizon tedavisi her alerji olgusunda uygulanmamalı, yalnızca kesinlikle gerekli olduğu durumlarda kullanılmalıdır.
Kortizon tedavisinin istenmeyen yan etkilerinin başında onikiparmakbağırsağmda ve midede ülser gelişme riskleri, önceden var olan ülserlerde de kanama ya da delinme riski gelir. Ülserli hastalara kortizon kesinlikle verilmemelidir.
Kortizonlu ilaçlar ağır ruhsal bozulduklarda, herpes enfeksiyonlarında, yeni cerrahi yaralarda ve kronik böbrek yetmezliğinde de kullanılmamalı, bulaşıcı hastalıklarda, yüksek tansiyonda, kalp yetmezliğinde ve şeker hastalığında ise çok dikkatle verilmelidir. Bazı alerjik durumlarda yerel olarak kortizonlu pomat ve kremlerin sürülmesi yararlı görünmektedir.